La IA de De la Fuente, Honoris Causa de la Universidad de León, continúa dando frutos

César de la Fuente, biotecnólogo formado en la Universidad de León (ULE), continúa desarrollando proyectos de alto impacto al otro lado del Atlántico mediante sistemas de inteligencia artificial (IA). El equipo de investigación que el Doctor Honoris Causa de la institución académica leonesa dirige en la Universidad de Pensilvania, en Estados Unidos, ha desarrollado ‘ApexFold’, una herramienta que predice cómo los péptidos cambian de forma en distintos entornos.

Tal y como explican desde la Universidad de Pensilvania, muchos péptidos cortos son flexibles y sensibles al entorno y para estas moléculas «el objeto biológicamente relevante, a menudo, no es una única estructura fija, sino un conjunto de conformaciones cuyas proporciones cambian». ‘ApexFold’, el sistema que ha ayudado a desarrollar el Honoris Causa de la ULE, representa directamente este comportamiento. A partir de una secuencia peptídica y de descriptores fisicoquímicos de su entorno, el modelo estima «las proporciones de conformaciones esperadas de tipo hélice alfa, de tipo beta y no estructuradas bajo cada condición». De esta manera, una misma secuencia puede recibir predicciones «diferentes en agua, en cosolventes orgánicos o en micelas que imitan las membranas». «La mayoría de los métodos de predicción estructural toman una secuencia y devuelven un único modelo. Pero la biología no funciona en un contexto único y estático. ‘ApexFold’ comienza a capturar esta dimensión que faltaba al aprender cómo la secuencia y el entorno determinan conjuntamente la respuesta estructural», detalla De la Fuente.

Para el desarrollo de esta herramienta basada en IA, el catedrático de la Universidad de Pensilvania, nombrado este año Doctor Honoris Causa de la ULE, trabajó junto a su equipo en el análisis de más de 1.500 péptidos y más de 5.000 observaciones de estos en distintos entornos. ‘ApexFold’ representa, en este sentido, «un paso hacia modelos que conectan la secuencia, el contexto y el comportamiento molecular».

Aunque gallego de nacimiento, De la Fuente se formó en la primera promoción de Biotecnología en León y su relevante trayectoria investigadora combina la IA, la biología sintética, la química, la microbiología y la medicina para acelerar el descubrimiento de nuevas biomoléculas y desarrollar enfoques novedosos. En este sentido, los trabajos del catedrático de la Universidad de Pensilvania y Honoris Causa de la ULE, de repercusión mundial, han ayudado a sacar adelante nuevos medicamentos.